La Comisión Permanente de la CEE está formada por la Comisión Ejecutiva, los presidentes de las Comisiones Episcopales y los arzobispos metropolitanos que no sean miembros de las anteriores comisiones:
A. Miembros de la Comisión Ejecutiva
- Juan José Omella Omella, arzobispo de Barcelona, presidente
- Carlos Osoro Sierra, arzobispo de Madrid, vicepresidente
- Luis J. Argüello García, obispo auxiliar de Valladolid, secretario general (hasta noviembre de 2023)
- Jesús Sanz Montes, OFM, arzobispo de Oviedo
- Ginés García Beltrán, obispo de Getafe
- Mario Iceta Gavicagogeascoa, obispo de Bilbao
- Jesús E. Catalá Ibáñez, obispo de Málaga
- José María Gil Tamayo, obispo de Ávila
- José Ángel Saiz Meneses, obispo de Tarrasa
B. Presidentes de las Comisiones Episcopales
- Alfonso Carrasco Rouco, obispo de Lugo, presidente de la Comisión Episcopal para la Educación y Cultura
- Amadeo Rodríguez Magro, obispo de Jaén, presidente de la Comisión Episcopal para la Evangelización, Catequesis y Catecumenado
- Carlos Escribano Subías, obispo de Calahorra y La Calzada-Logroño, presidente de la Comisión Episcopal para los Laicos, Familia y Vida
- José Leonardo Lemos Montanet, obispo de Orense, presidente de la Comisión Episcopal para la Liturgia
- Francisco Pérez González, arzobispo de Pamplona y Tudela, presidente de la Comisión Episcopal para las Misiones y Cooperación con las Iglesias
- Atilano Rodríguez Martínez, obispo de Sigüenza-Guadalajara, presidente de la Comisión Episcopal para la Pastoral Social y Promoción Humana
- Luis Ángel de las Heras Berzal, CMF, obispo de Mondoñedo-Ferrol, presidente de la Comisión Episcopal para la Vida Consagrada.
- Joan Enric Vives Sicilia, arzobispo-obispo de Urgell, presidente de la Comisión Episcopal para el Clero y Seminarios
- Juan Del Río Martín, arzobispo castrense de España, presidente de la Comisión Episcopal para las Comunicaciones Sociales
- Enrique Benavent Vidal, obispo de Tortosa, presidente de la Comisión Episcopal para la Doctrina de la Fe
C. Arzobispos metropolitanos
- Antonio Cañizares Llovera, arzobispo de Valencia
- Ricardo Blázquez Pérez, arzobispo de Valladolid
- Julián Barrio Barrio, arzobispo de Santiago de Compostela
- Juan José Asenjo Pelegrina, arzobispo de Sevilla
- Celso Morga Iruzubieta, arzobispo de Mérida-Badajoz
- Vicente Jiménez Zamora, arzobispo de Zaragoza
- Fidel Herráez Vegas, arzobispo de Burgos
- Joan Planellas, arzobispo de Tarragona
- Francisco Cerro Chaves, arzobispo de Toledo